不同物料因理化特性存在差異，適宜發酵的水分含量是不一樣的，同時溫度、適度等環境因素也會對其產生影響。通常情況下，水分偏低或偏高，會導致堆肥堆體溫度急劇上升，或形成“燒白”，或發酵溫度居高不下；水分過低或偏高，往往會不升溫，即無發酵溫度產生。關于堆肥物料的水分控制和調節，一般應遵循以下原則。
1，南風地區的物料水分應適當調低，北方地區適當調高。南方地區空氣濕度大，物料水分的自然揮發或蒸發量小，所以物料水分相對于北方來說應調低一些。
2，雨季時應適當調低物料水分，旱季適當調高。主要原因是空氣濕度會對水分自然揮發或蒸發量產生影響。
3，低溫季節適當調低，高溫季節適當調高。環境溫度較低時，發酵溫度上升相對緩慢，熱量損失大，水分揮發少，環境溫度較高時則正好相反。
4，陳料熟料適當調低，鮮料適當調高。陳放時間較長的物料在陳放過程中，環境微生物已將部分有機物不同程度分解，相對于新鮮物料其生化反應過程的劇烈程度有所減弱，水分需求量相對也要少，經過物理或化學手段處理后的物料，其生化反應的需水量更少。
5，低C/N適當調低,高C/N適當調高。C/N低以為這可分解的碳水化合物數量少，生化反應的需水量也少，反之則需水量大。
總之，應根據地域、氣候、物料及配方的特點，摸索相應的最適水分含量，并在堆肥化過程中，仔細觀察物料的水分變化及對堆肥化的影響，及時采取調整措施，確保發酵的正常進行。
